Szent Mihály üvegablak ábrázolás: a szentélyben helyet kapó üvegablak Szent Mihály figuráját ábrázolja. A templom védőszentjének alakját ovális dicsfény emeli ki. A kék égbolt felett lebegő alak egyik kezében lángpallost tart hirdetve, hogy legyőzte Lucifert, a fellázadt angyalok vezérét. A másik kezében pajzs van. Az eredeti üvegablak Waltherr Gida alkotása a 20. század elejéről, amely a II. világháború alatt súlyosan megsérült, de dokumentumok alapján sikerült az eredeti stílusban új ólomablakokat elhelyezni.

A szentély üvegablakai: A Szent Mihályt ábrázoló üvegablakok mellett további üvegablakok is Waltherr Gida századelős alkotásainak motívum- és formavilágára hangolva készültek. Az eredeti alkotások a II. világháborúban sérültek meg, melyekhez hasonló, színes alkotások a jelenleg is folyó felújításnak köszönhetően készültek el. Ezeken felül egy kilenc elemből álló rózsaablak kompozíció is található a templomban.

Oltár: A jelenlegi nagy beruházás eredményeként a székesegyház oltára is megújult. Az új oltárt, az ambóval, a szenteltvíztartóval és a tabernákulummal együtt egyetlen hatalmas kőtömbből faragták ki. Az öttonnás ónix tömböt, amelyből elkészültek az alkotások Olaszországban, Veronában választották ki. Az elkészült oltár súlya 1,2 tonna, mely miatt az építészek a szentélyfödémet is megerősítették, hogy biztosítsák az altemplom szerkezeti épségét.

Orgona: A 2021 óta folyó munkálatok egyik első lépéseként a főszékesegyházban található orgona felújítását és bővítését is elkezdték. A hangszer elkészítése több, mint 17 ezer munkaórát vett igénybe és volt olyan időszak, amikor 50 ember is dolgozott rajta. A munka eredményeként 2023 tavaszára már visszakerült eredeti helyére. Az épülethez méltó, hatalmas hangszert közel 2500 síp szólaltatja meg, mely lehetőséget biztosít színes és változatos előadásokhoz. A legnagyobb síp mérete 5,2 méter, a legkisebbé 3,5 milliméter.

Padányi Biró Márton szarkofágja: A gótikus stílusban épült altemplomban több püspöknek is áll emléke. Többek között itt található Beriszló Péter 1520-ban a török elleni harcban elesett püspök, valamint Bánáss László püspök (1946 – 1949) sírlapja. Emellett az altemplomból nyíló kápolnában található Padányi Biró Márton püspök (1745 – 1762) barokk szarkofágja, melyben hamvait is őrzik.